Comparações a posteriori em permanova

Dúvida do Allan no Webnário:

Olá! se caso nas multivariadas eu tiver três tratamentos, como é que na anova eu faço um pós teste de comparações múltiplas, feito o Tukey?

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Um exemplo com comparações planejadas:
http://thebiobucket.blogspot.com.br/2011/08/two-way-permanova-adonis-with-custom.html

Um pacote para fazer todas as comparações automaticamente:
https://github.com/pmartinezarbizu/pairwiseAdonis