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PCA: como incluir os nomes dos tratamentos?

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PCA:  como incluir os nomes dos tratamentos? Empty PCA: como incluir os nomes dos tratamentos?

Mensagem por kmariguele Sex Jul 17, 2020 12:02 pm

Bom dia

Gerei uma imagem com PCA, porém não aparece o nome dos tratamentos conforme consta no arquivo de dados. Aparece sit1, sit2 etc. Como faço para que apareça os nomes os tratamentos?

pca1<-read.table("pca1.txt", h=T, sep = "\t", dec=".", stringsAsFactors = T)
var<- pca1[, 2:10]
library(vegan)
pca<-rda(var, scale =T)
summary(pca)
biplot(pca)

Alguém poderia me ajudar?

Keny

kmariguele

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PCA:  como incluir os nomes dos tratamentos? Empty Re: PCA: como incluir os nomes dos tratamentos?

Mensagem por Prof. Marcos Seg Jul 20, 2020 9:53 am

Oi, Keny.

Ao ler os dados, você precisa ter uma primeira coluna com os nomes que deseja que apareçam, e adicionar o row.names=1 como argumento (no read.table ou no read.csv; se estiver usando alguma outra função para ler os dados, confira se é o mesmo argumento, ou se tem outro para ser usados).

Outra possibilidade é adicionar os nomes depois, usando a função rownames(), mas acho que ler direto é bem mais prático.
Prof. Marcos
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