Modelo de redes de interação

Eu estou tentando rodar um modelo com 1.000 amostras de redes de interação que são criadas aleatoriamente a partir de um banco de dados.

E agora durante a análise, começou a aparecer o seguinte erro:
Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection In addition: Warning
message: In file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open file 'web-1-1.pairs': Permission denied

Aparentemente, durante a análise é gerado um arquivo que neste caso é o 'web-1-1.pairs', e o mesmo tem acesso negado, não finalizando a análise para as 1.000 redes de interação.
Pelo que andei pesquisando, este erro pode acontecer quando:

Tem um arquivo aberto em outro programa, como o Excel, enquanto tenta gravá-lo..ou se o diretório de trabalho não tenha acesso para gravação a esse diretório.. mas acredito que isso não seja meu caso..

Por um acaso, alguém conhece ou já teve esse erro no R?

Obrigado