Curva do coletor

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Curva do coletor

Mensagem por carol_lopes85 em Seg Ago 06, 2018 2:50 pm

Prezados.

Preciso montar um gráfico (curva do coletor) que aparece os valores observados e os valores estimados, como Jackknife.

Como devo proceder???

Att.
Carolina A. Lopes

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Re: Curva do coletor

Mensagem por Leonardo P. A. Resende em Qui Set 20, 2018 10:06 pm

Olá Carol Lopes, tudo bem?!

Sou Leonardo Resende, fiz o curso de R da turma do ano passado! Estou fazendo um trabalho para um relatório de consultoria e preciso também fazer um gráfico com a curva da rarefação e com a curva do estimador Jackknife. No Blog do Prof. Marcos Vital "Cantinho do R" tem um script muito massa para cosntruir uma curva de rarefação bem bonita!
Aqui eu venho reforçar a sua pergunta ao Prof. Marcos e pedir auxílio no sentido de incorporar uma curva de estimador de riqueza no script da curva de rarefação!

Att.
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Re: Curva do coletor

Mensagem por Prof. Marcos em Seg Out 15, 2018 8:48 am

Obrigado pela força, Leonardo!

Carolina, eu respondi uma pergunta semelhante neste tópico aqui: http://programa-r.forumeiros.com/t208-curva-de-acumulacao-de-especies-no-ggplot2

E nele há alguns links, incluindo para o script que o Leonardo mencionou.

Avise se deu certo, ou se ainda tiver alguma dúvida, ok? E lembre-se de que teremos um módulo só sobre biodiversidade, que inclui isso. Wink

Abraços!
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Re: Curva do coletor

Mensagem por Leonardo P. A. Resende em Qui Out 18, 2018 2:28 pm

Olá Prof. Marcos,

Olhei aqui o pacote iNEXT e achei ele bem interessante, mas nos documentos que estão disponíveis no link que vc passou, não fica claro quais são os estimadores que as funções do pacote calcula. Você teria nformações sobre isso?

Leonardo P. A. Resende

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Re: Curva do coletor

Mensagem por Leonardo P. A. Resende em Qui Out 18, 2018 2:36 pm

Na verdade, pelo que consegui entender ele não usa os estimadores que estamos acostumados a usar, mas sim esses tais números de Hill, que desconheço a natureza. Quando for o webnário do módulo de diversidade eu gostaria de poder enveredar por esse tema para aprender um pouco mais sobre essas metodologias.

Leonardo P. A. Resende

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Re: Curva do coletor

Mensagem por Prof. Marcos em Sex Out 19, 2018 4:44 pm

Oi, Leonardo!

Isso, o iNEXT não usar os estimadores tradicionais como Jacknife ou Chao: e é nisso que ele é realmente legal! Wink

Os estimadores "clássicos" são interessantes, mas possuem alguns vícios. O principal é que eles tendem a não se estabilizar: quanto mais você coleta, mais eles continuam a estimar. Além disso, eles apresentam um problema de interpretação: a estimativa deles não apresenta um esforço amostral base, de forma que você não consegue transformá-la em algo concreto.

No iNEXT a estimativa é uma extrapolação da curva de acúmulo: você se pergunta, por exemplo, quantas espécies espera encontrar se coletar o dobro do que coletou. Assim temos uma estimativa mais realista e interessante de se interpretar.

No módulo 7 vou falar sobre ele, então se a documentação do pacote ainda estiver deixando tudo vago, espere mais um pouquinho, pois vamos chegar lá, ok?

Abraços!
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Re: Curva do coletor

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