Como criar um heatmaps para genes

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Como criar um heatmaps para genes

Mensagem por Paulo Sérgio Amorim em Ter Jul 24, 2018 8:33 pm

Olá!

Como eu poderia elaborar um heatmaps para genes?

Estou tentando utilizando a função heatmap ().
Minhas colunas são:

Gene Tempo  Expression     Result
PGM     0      -0.8211260        0
PGM    14     -2.3364277        0
PGM    30    1.4308205        1
PGM     90      0.3345683        3

Coluna 1: Gene
Coluna 2: Tempos de coleta
Coluna 3: Expressão relativa do gene
Coluna 4: se ele aumenta ou diminui em relação ao genótipo não responsivo
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Paulo Sérgio Amorim

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Re: Como criar um heatmaps para genes

Mensagem por Prof. Marcos em Seg Nov 12, 2018 10:16 am

Olá, Paulo, tudo bem?

Desculpe pela demora, o tópico com a sua pergunta estava láááá em baixo, e estou fazendo uma revisão dos tópicos antigos sem resposta, e apenas agora eu encontrei.

Ainda está lidando com isso, ou é algo já resolvido? Se não for, dê mais detalhes do que você pretende fazer. O heatmap, no caso, seria para representar uma matriz de distância? Se sim, você tem que calculá-la primeiro, para depois usar a função.

Qualquer coisa vamos nos falando.

Abraços!
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Prof. Marcos

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